Fermentai ląstelėse retai būna nuolat aktyvūs. Jų aktyvumas dažnai būna reguliuojamas.

Kaip vadinamas fermento aktyvumo reguliavimas, kai jo aktyvumą mažina (slopina) jo produktas, taip reguliuodamas savo gaminimo greitį?

Kuris iš šių fermento aktyvavimo būdų yra silpniausias, dėl to grįžtamas, tačiau suveikiantis greičiausiai?

Kuris iš šių fermento aktyvavimo būdų yra geriausias ilgalaikiam fermento išjungimui (inaktyvavimui), tačiau yra grįžtamas ir fermentas gali būti aktyvuojamas, kai to reikia?

Kuris iš šių fermento aktyvavimo būdų yra pagrindinis virškinimo fermentų aktyvavime?

Pagal fermento veikimo aprašymą, pasirinkite, koks fermento veikimo būdas aprašytas.

Fermento aktyviajame centre elektronų nešiklis (kofermentas) prisijungia kišenėje, greta substrato ir nuo substrato H- jonas pernešamas ant kofermento anglies atomo, esančio piridino žiede.

Fermento aktyviajame centre esanti histidino aminorūgšties šoninė grandinė per azoto atomą prisijungia nuo hidrolizėje dalyvaujančios vandens molekulės atskylantį H+ joną, o vėliau jį atiduoda nueinančiam produktui.

Peptidinės grupės hidrolizės reakcijos metu, fermento aktyviajame centre esančio aminorūgšties serino funkcinė grupė atakuoja peptidinio ryšio C atomą ir pakeičia prie jos prijungtą azoto atomą, susidarant pirmam produktui. Vėliau šį fermento-substrato kompleksą (esterinę grupę)  

Dihidroksiacetono fosfatas prisijungia prie fermento aktyviojo centro, sudarydamas vandenilinius ryšius per OH ir fosfato grupes, bei joninę fosfatinės grupės sąveiką su fermento arginino grupe. Dėl šių sąveikų substrato tam tikri ryšiai susilpnėja, todėl yra kurs kas lengviau nutrūksta, ir padedant fermentui, sudaromi nauji.

Atsakykite į klausimus, įrašydami monosacharido, disacharido ar polisacharido pavadinimą. Atsakykite vienu žodžiu, naudodami patį paprasčiausią angliavandenio pavadinimą.

Cukrus, esantis DNR struktūroje: 

Cukrus, nulemiantis kraujo grupę B: 

Disacharidas, kurį augalai naudoja angliavandenių transportui iš lapus į kitas augalo dalis: 

Struktūriškai stabiliausia aldoheksozė: 

Disacharidas, gaunamas suhidrolizavus celiuliozę: 

Disacharidas, randamas žinduolių piene: 

Krakmolą sudaro du polisacharidai, vienas iš jų yra šakotas. Parašykite jo pavadinimą: 

Koks disacharidas susidaro suhidrolizavus linijinės formos krakmolo polisacharidą: 

Neredukuojantis monosacharidas, esantis sacharozės sudėtyje: 

Polisacharidas, kurį gamina dumbliai ir kuris yra naudojamas DNR elektroforezei: 

Deoksimonosacharidas, sutinkamas ABO kraujo grupių antigenų struktūroje: 

Struktūrinis gyvūninis polisacharidas, sudarytas iš modifikuotos gliukozės monomerų: 

Diagramoje pavaizduota to paties fermento katalizuojamos reakcijos su grįžtamu slopikliu ir be slopiklio pradinio reakcijos greičio priklausomybės nuo substrato koncentracijos.

!!! Skaitmeniniams atsakymams, jeigu rašote dešimtainę trupmeną, rašykite su TAŠKU, ne su kableliu!

Katalizuojamos reakcijos maksimalus greitis (Vmax) abiem atvejais yra vienodas. Iš kreivių apytiksliai nustatykite, koks jis?

Taip pat iš kreivių nustatykite, kokios yra Michaelio konstantų reikšmės Km abiem reakcijoms? Be slopiklio: ; Esant slopiklio:

Kuris slopinimo būdas atitinka pavaizduotus duomenis?

Jeigu fermento katalizuojama reakcija Substratas → Produktas yra negrįžtama, taip pat yra žinoma, kad produktas negali jungtis niekur kitur prie fermento, išskyrus aktyvųjį centrą, kokiu mechanizmu jis slopins vykstančią reakciją? 

Jeigu tam tikros fermento katalizuojamos reakcijos Vmax yra 100 μM/min, Km = 15 mM, o fermento koncentracija - 4 μM, koks yra šio fermento apsisukimų skaičius (turnover number) - kiek substrato molekulių jis gali paversti produktu per vieną minutę? 

Įsivaizduokite, kad turite keturis skirtingus fermentus, kurie katalizuoja tą pačią reakciją.

Fermento A Km substratui yra 100 mM, o Vmax geriausiomis sąlygomis - 100 mM/min.

Fermento B Km substratui yra 10 mM, o Vmax geriausiomis sąlygomis - 50 mM/min.

Fermento C Km substratui yra 1 mM, o Vmax geriausiomis sąlygomis - 1 mM/min.

Fermento D: Km substratui yra 1 mM, o Vmax - geriausiomis sąlygomis - 10 mM/min.

Kuris fermentas būtų geriau pritaikomas biokatalizėje (cheminių medžiagų sintezėje, panaudojant fermentus), o kuris - junginių (pvz. priemaišų) detekcijai (priemaišos yra tas pats jo substratas, o vykstanti reakcija parodo, kad ten yra tos medžiagos)?

Pavaizduotas tam tikro fermento aktyvaus centro aminorūgščių išdėstymo schema:

Žemiau pateiktas tas pats substratas, tačiau orientuotas skirtingai. Nurodykite raidę orientacijos, kuri geriausiai prisijungs prie pateikto aktyvaus centro: 

Trijų raidžių kodu nurodykite fermento aminorūgštį, su kurios šonine grupe kontaktą sudarys substrato OH grupė:

Trijų raidžių kodu nurodykite vieną aminorūgštį, per kurios šoninę grupę kontaktą sudarys substrato karboksilato grupė? 

Pateikta šio fermento kito substrato struktūra: 

Šis substratas neturi OH grupės žiede, todėl nesudarys tam tikrų ryšių su fermentu. Norodykite fermento aktyviajame centre vieną iš aminorūgščių (trijų raidžių kodu), kuri sudarys kontaktą su šio substrato fenilo grupe: 

Pavaizduotas tam tikro fermento katalizuojamos reakcijos mechanizmas. Surašykite šios reakcijos mechanizmo stadijas iš eilės. Pirmas junginys jau yra pažymėtas. 

Pagal savo užsirašytą numerių seką atsakykite, kuris po kurio eina (jeigu tai paskutinė stadija, tai įrašykite nulį):

Pateikta gliukozės struktūra, kurioje skaičiais sužymėti anglies atomai. 

Atsakydami į klausimus, nurodykite anglies atomų numerius. Jeigu reikia nurodyti keletą numerių, juos užrašykite BE TARPŲ ar SKYRYBOS ženklų, DIDĖJANČIA tvarka, pvz: 123456

Šis cukrus yra priskiriamas D angliavandeniams. Kurio vieno C atomo konfigūraciją (H ir O ryšio padėtis) pakeitus, jis būtų priskiriamas L angliavandenių grupei? 

Kurio C atomo konfigūraciją pakeitę, gautume šio junginio anomerą? 

Kurių C atomų konfigūracijas pakeitę, gautume šio junginio enantiomerą? 

Kurio C atomo konfigūraciją pakeitus, gautume šio junginio epimerą? Galimi keli teisingi atsakymai, įrašykite VIENĄ: 

Gliukozė, kaip ir fruktozė gali būti tiek piranozės, tiek furanozės formoje. Kurio anglies OH grupė dalyvauja ciklo susidaryme gliukozės furanozės formoje? 

Gliukozės monomerai gali sudaryti kelių rūšių polisacharidus. 

Nurodykite, kurie C atomai dalyvauja, susidarant ryšiams glikogeno molekulėje: 

Nurodykite, kurie C atomai dalyvauja susidarant ryšiams amilopektino molekulėje: 

Gliukozė yra redukuojantis cukrus. Kuris C atomas pasižymi geromis redukcinėmis savybėmis? 

Pateiktas peptidas buvo paveiktas proteaze chimotripsinu. 

Vienos raidės kodu užrašykite šio peptido aminorūgščių seką: 

Vienos raidės kodu nurodykite, kokie mažesni peptidai (jų sekos) ar aminorūgštys susidarys po hidrolizės?

Peptidai turi būti nurodyti iš eilės pagal jų vietą pradinės molekulės sekoje. Peptide yra viena aminorūgštis, kuri neleidžia fermentui perkirpti peptido, net jeigu toje vietoje jis atpažintų kirpimo vietą. Šioje užduotyje galite į šį faktą nekreipti dėmesio, atsakymai bus užskaitomi, bet jeigu visgi sutikote tokią situaciją, ir gautų produktų skaičius gavosi mažesnis, negu yra langelių, į atlikusius langelius įrašykite tos kirpimą blokuojančios aminorūgšties kodinę raidę.

, , , .

Atsakykite į pateiktus klausimus. Atsakymai - 1-3 žodžiais. Jeigu prašoma nurodyti aminorūgštis, nurodykite vienos raidės kodu, be tarpų, be skyrybos ženklų, bet kokia tvarka). Dėl kitų atsakymų per daug nesukite galvos dėl specifinės formuluotės, visus neteisingus atsakymus patikrinsiu "rankiniu" būdu.

1. Kolageno pirminėje dar nemodifikuotoje struktūroje vyrauja šios 2 aminorūgštys (nekreipiant dėmesio į modifikacijas): 
2. Didelis šių aminorūgščių kiekis padaro polipeptidinę grandinę (kokią)
3. Dažnai sutinkama potransliacinė modifikacija: . Modifikuojamos aminorūgštys: 
4. Dėl šių modifikacijų tarp grandinių gali susidaryti daugiau tarpmolekulinių  ryšių, todėl kolageno struktūra būna tvirtesnė.
5. Šiai potransliacinei modifikacijai įvykdyti reikalingas vitaminas 
6. Antrinė struktūra beveik visame baltyme yra: 
7. Tretinės struktūros nelabai turi, nes tai yra ne globulinis, o baltymas.
8. Ketvirtinė struktūra yra vadinama:
9. Daug šio baltymo sutinkama audinyje.
10. Kituose audiniuose jo taip pat yra tarp ląstelių, kur jis kartu su  sudaro .