Es más ácido en el citosol que en el lumen endosomal.

El pH del lumen del retículo endomplasmático permite el reconocimiento de las enzimas hidrolíticas lisosomales mediante la acción del receptor de Manosa-6-fosfato (M6P).

Es un factor regulador de la unión y desunión entre un ligando y su receptor.

A pH básico se activan las enzimas hidrolasas lisosomales.

Es el mismo en el lumen de todos los orgánulos membranosos.